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Fallstudie: Entwicklung einer mehrskaligen ML-Architektur für die Modellierung der Meeresbiogeochemie
Herausforderung

Ein führendes, von der NSF gefördertes Meeresforschungszentrum musste grobgranulare Modelle der Meeresbiogeochemie mit feingranularen mikrobiellen Stoffwechselmodellen verbinden, ein Prognoseproblem ohne etablierte Machine-Learning-Lösung. Die verfügbaren Daten waren über sechs inkompatible Quellen fragmentiert und umfassten 40 Jahre ozeanografischer Zeitreihen, Feld-Metabolomik, Omics-Daten und Laborexperimente.

Lösung
  • Entwicklung individueller Datenintegrationspipelines zur Vereinheitlichung heterogener ozeanografischer Quellen sowie Erstellung tiefengebündelter, profilaggregierter Merkmalsvektoren für das ML-Training
  • Vorschlag einer Modellarchitektur für Multi-Output-Regression von DOC-Zusammensetzung zu einzelnen Metabolitkonzentrationen
  • Vorschlag einer Modellarchitektur für cross-modale Prognosen, die die Zusammensetzung von Phytoplankton-Gemeinschaften mit Expressionsprofilen bakterieller Transporter verknüpfen
Ergebnisse
  • Lieferung einer vollständig reproduzierbaren Datenpipeline und ML-Architektur-Roadmap, die direkt in die NSF-Präsentation des Kunden und die nächste Datenerhebungskampagne einfloss
  • Identifizierung verbindlicher Datenbeschränkungen, die die Priorisierung nachfolgender Modellierungsphasen prägten

Durch die Auflösung fragmentierter Altdaten und die Konzeption zweier neuartiger ML-Prognosepipelines gab ISC dem Kunden eine belastbare technische Grundlage, um weitere NSF-Fördermittel zu sichern und die nächste Feldkampagne gezielt dort auszurichten, wo sie am wichtigsten ist.

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